Fue fundado en 1760 por el colonizador español Juan Antonio Fajardo, de cuyo apellido proviene el nombre del municipio, y en 1772 fue llamado Villa de Fajardo . El municipio de Fajardo está organizado, territorialmente, en 8 barrios más el Fajardo Pueblo, el centro administrativo y principal pueblo del municipio.
Bandera
Mapa
Himno
Letra: Juan R Marrero, 1997
Fajardo que aquí en el oriente,
paciente como un pescador,
atrapas en el horizonte
el primer rayito de sol
Lo reflejas en Sardinera
lo esparces a tu alrededor
llevándole la luz a Boriquén
que brilla como un prendedor.
Fajardo escogido del cielo
mi pequeño pueblo quiero
decirte que eres orgullo
de todo buen Fajardeño
Así vivas sierra adentro
o en la playa Puerto Real
Fajardo que aquí en el oriente,
paciente como un pescador
atrapas en el horizonte,
el primer rayito de sol.
Lo refeljas en Sardinera
lo esparces a tu alrededor
llevándole luz a Borinquen
que brilla como un prendedor.